茶叶是世界上种植规模最大、消费人群最广的饮料植物之一。随着茶树育种从常规技术走向智能设计育种,掌握种质资源的基因信息、使种质资源真正发挥种业创新的“芯片”作用,已成为世界各国茶树育种的主攻方向。
近日,国际知名期刊《Journal of Nanobiotechnology》(中科院1区TOP,IF=12.6)在线发表了重点实验室共建单位中国农业科学院茶叶研究所茶树种质资源创新团队题为TEA5K: a high-resolution and liquid-phase multiple-SNP array for molecular breeding in tea plant的研究论文。研究基于靶向测序基因分型(Genotyping by Target Sequencing, GBTS)技术,首先对我国200多个主要茶树育成品种进行了基因型检测,结果显示同一品种内的遗传相似度在 92.53% 以上,而不同品种间的遗传相似度均低于 82.36%,这为设定阈值实现茶树品种的准确鉴别留下了充足空间;随后课题组利用该芯片,构建了一张包含 3274 个SNP标记,总图距长2225.19cM的遗传图谱,并利用该图谱定位了茶树氨基酸组分相关的多个QTL位点,以及与‘黄金芽’品种白化叶色变异相关联的两个紧密连锁的分子标记;最后,课题组利用该芯片对 519 份茶树种质资源的群体结构和系统发育关系进行了分析,结果表明现代栽培品种的遗传多样性低于地方资源,此外野生资源与现代栽培品种之间也存在显著的遗传分化,这为我们今后充分利用野生茶树改良现代品种提供了理论依据。
