重点实验室实行建设与管理委员会、学术委员会指导下的实验室主任负责制，滇西科技师范学院是重点实验室的管理主体和责任主体，设立建设与管理委员会（以下简称管理委员会），由依托单位分管业务的副校长、保障管理处、科学技术处，实验室主要负责人等组成，是重点实验室建设与管理工作的指导机构。实验室重要事务由实验室主任召集管理委员会讨论决定，管理委员会围绕树立严谨治学的学风、营造活跃的学术氛围、建设创新文化、保障生产安全等内容不断完善实验室管理制度，负责统筹协调依托单位及各部门对实验室的条件保障。重点实验室同时设立由本领域知名专家组成的学术委员会，主要职能是审议实验室的研究方向、研究重点、评议课题的研究进展、审批开放课题和审议实验室重大学术活动等。设立建设与管理委员会、学术委员会，重点实验室实行实验室主任、副主任和研究中心负责人三级管理模式，进行实验室的日常管理工作。拟设置实验室主任1名，副主任1名，重点研究方向带头人3名、成立1个综合办公室和3个研究中心。